În cazul unei noi crize sanitare, autoritatea va activa fondurile de urgență și se va ocupa de monitorizarea situației și de procurarea de echipamente și medicamente.
Autoritatea este concepută în mare parte pentru a evita repetarea scenariului pe care l-a ”trăit” blocul comunitar în momentul izbucnirii pandemiei de coronavirus care a prins pe nepregătite toată lumea, majoritatea țărilor confruntându-se într-o primă etapă a pandemiei cu o criză a echipamentelor speciale de protecție.
Acest organism va colabora cu alte agenții europene, inclusiv cu Centrul de prevenție a bolilor și cu Agenția Europeană a Medicamentului (EMA).